Dans un monde où les pierres sont au centre de toute activité humaine, Kai, 15 ans, vit depuis toujours dans un village souterrain. Il ne connaît rien du monde qui l'entoure. Même s'il rêve d'aventure, il n'a jamais vu le « monde de la surface ». Kai fait un jour la connaissance de Akeboshi, un minéralogiste puissant, au passé mystérieux. Akeboshi, qui a toujours refusé de former un disciple, contre toutes attentes, se montre intéressé par le potentiel de Kai, malgré (ou grâce à ?) sa jambe pétrifiée 3 ans plus tôt et maintenant constellée de diamants rouges. Cette rencontre va bouleverser la vie du jeune homme, car en plus de lui apprendre un tas de choses sur le monde et de lui révéler ses aptitudes insoupçonnées, Akeboshi pourrait aider Kai à délivrer ses proches de la pétrification totale qui les frappés. Mais pour cela, il faut d'abord retrouver les responsables ! Accrochez-vous ! Par le pouvoir des pierres, cette série mérite votre « gemme » !
Kai a réussi à contrer l'homme mystérieux qui manipule les pouvoirs de l'antimoine grâce au pouvoir du diamant ! La Guilde arrive en renfort, mais l'assaillant parvient à s'échapper. Akeboshi et Kai continuent leur voyage avec pour nouvel objectif de trouver une arme pour Kai. Ils partent à la rencontre d'un armurier, connaissance de longue date d'Akeboshi, mais ils ne peuvent s'empêcher d'attirer les problèmes... Kai réussira-t-il à sauver la mise grâce à l'un de ses talents cachés !?
Akeboshi passe outre son aversion pour Tsuzumi et s'allie à lui dans l'espoir de capturer Yukari, la mangeuse de pierres qui a pétrifié Kai. Akeboshi et ses compagnons laissent de côté les doutes qu'ils entretiennent concernant les intentions de la Guilde des minéralogistes et se dirigent vers le repaire présumé de Yukari. Cependant, tout ne se passe pas comme prévu...! De son côté, Kai est plongé au sein d'un monde subconscient dans lequel il est confronté à une épreuve !! Quel problème doit-il surmonter pour atteindre la récompense promise, à savoir un supplément d'énergie !?
Kai a réussi à retrouver son état normal avec l'aide d'Akeboshi et du jeune garçon rencontré dans la « veine » ! Fort de l'énergie acquise pendant son épreuve, il fait désormais face à Kurotobi... Sakon et Kô, de leur côté, se retrouvent face à Yukari. Maîtres et élèves combattent ensemble pour barrer la route à leurs ennemis !
Benito est touché par une flèche empoisonnée au cours d'une attaque surprise orchestrée par la bande Hinosuna. Tandis qu'Akeboshi se bat contre les pillards afin de mettre la main sur l'antidote, Kai, Kô et Kurogane entrent dans les vestiges du village de Ryûjin ! Différentes épreuves attendent nos trois héros, qui devront essayer de les surpasser. Qu'est-ce qui les attend au bout de toutes ces épreuves ?!